Исследования последних лет по изучению экспрессии генов позволили определить различные подтипы рака молочной железы. Молекулярные характеристики определяют опухоли, имеющие высокий уровень экспрессии гена рецепторов эстрогенов ( РЭ) двух подтипов: люминальный А и В, и не экспрессирующиющие РЭ. Последние, в свою очередь делятся на опухоли с НЕR2-позитивным типом и, так называемый, тройной негативный рак, характеризующийся отсутствие как НЕR2, так и обоих типов рецепторов ( РЭ и РП). В некоторых работах было показано, что тройной негативный подтип чаще встречается при наличии мутаций BRCA1 с большим числом низкодифференцированных опухолей, отличающимся высоким ядерным индексом Блэка. От 50 до 88% BRCA1-положительных больных имеют тройной негативный рак молочной железы, по сравнению с 14-34% в отсутствии обозначенной мутации. Наличие данной закономерности привело к возникновению мысли о том, что биологические характеристики опухоли могут свидетельствовать о статусе BRCA. Модель BRCA-РRО включала помимо Кi 67 статус по рецепторам эстрогенов и прогестерона, степень злокачественности и эпидермального фактора роста. Оказалось, что у женщин до 54 лет высокий уровень Кi 67 в 75% ассоциирован с наличием мутации BRCA1.

Для BRCA2-ассоциированного рака также описано ряд интересных фактов: возраст этих пациенток с тройным негативным раком был больше, чем в группе с мутацией BRCA1; они чаще получали гормонозаместительную терапию, что, возможно, взаимосвязано.